این مدرسه در اواخر دوره حکومت صفویه به دست فردی به نام "میر علی بیک" ساخته شده و تا سال‌های پیش از زلزله سال ۱۳۴۷، به عنوان مدرسه مورد استفاده بوده‌است. از مشخصات بارز در معماری مدرسه علیا، تکرار فرم هشت ضلعی در قسمت‌های مختلف پلان آن است.

مسجد و حمام کوشک در شرق شهر تون و نزدیک به دروازه قاین قرار دارد. بر بالای محراب مسجد کوشک، کتیبه‌ای آراسته به گچ‌بری گل و بوته با تاریخ (۵۵۴ ه.ق) دیده می شود. بر اساس شواهد، معماری موجود و فرم مسجد، بنای اولیه مسجد به اوایل اسلام برمی‌گردد.