به استناد كتيبه موجود در ايوان مسجد جامع، اين بنا در سال 796 هـ. ق به دستور امير جمشيد قارني ساخته شده است. بنابراين مسجد جامع قاين از آثار ساخته شده در اواخر دوره ايلخاني و اوايل دوره تيـموري است. اين اثر داراي اجزايي از قبيل صحن، ايوان، شبستان‌‌ها، حجره‌ها، در ورودي، پاياب و ساعت آفتابي است. 

حکیم بوذر جمهر قاینی سیاستمدار ادیب و عارف و شاعر اواخر قرن چهارم و اوایل قرن پنجم هجری قمری است که در دربار سلطان مسعود غزنوی خدمت می کرده است. وی به زبان فارسی و عربی سخن می گفته و از وی اشعار و قصیده هایی به جای مانده که قصیده بهاریه او از شهرت خاصی بر خوردار است.